Hi,
hast Du schon jemals Kotproben untersuchen lassen?
Wenn Du den Eindruck hast, Dein Leguan könnte unter Parasiten leiden und Du kannst partout keinen Kot finden, dann schnapp ihn Dir und fahr zum reptilienkundigen Tierarzt. Der wird ggf. eine Kloakenspülung durchführen und dadurch Kot gewinnen, der untersucht werden kann.
Allerdings würde ich das nur machen, wenn das Tier innerhalb kurzer Zeit deutlich abnimmt und auch sonst nicht fit zu sein scheint. Ansonsten würde ich noch etwas warten. Wenn oben was reinkommt, muss unten auch was rauskommen

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Was fütterst Du denn? Ist was dabei, was Verstopfung auslösen könnte? Welcher Bodengrund?
LG Jana